B. Sejarah Singkat Berdirinya Madarasah Tsanawiyah Negeri 2 LamonganBerawal dari Lembaga Pendidikan Guru Agama (PGA) 4 Tahun “Falakhiyah“ Glagah, yang waktu itu belum ada lembaga pendidikan Agama tingkat SLTP yang berstatus Negeri di sekitar kecamatan Glagah khususnya, maka dengan melihat perkembangan pendidikan ke depan, pengurus berinisiatif untuk mengusulkan menjadi MTs yang berstatus Negeri, kebetulan pada waktu itu ada relokasi dari MTs. Negeri Magetan, yang kemudian penempatan sementara di gedung PGA 4 th. “Falakhiyah” Glagah, yang waktu itu satu gedung dengan MI “Falakhiyah” Glagah.
Tepatnya pada tahun 1980 statusnya menjadi Negeri dengan nama MTs. Negeri 2 Lamongan.
Tahun pertama dengan 2 lokasi pembelajaran yang berjauhan yaitu di : gedung MI Falakhiyah Glagah dan di depan Balai Desa Glagah, tepatnya yang sekarang ini ditempati bangunan Koramil kecamatan Glagah.
Sekitar tahun 1985 menempati 3 lokasi pembelajaran yang berjauhan yaitu di: Gedung MI Falakhiyah Glagah , Gedung depan Balai Desa Glagah (yang sekarang ditempati bangunan Koramil kecamatan Glagah) dan di tanah milik sendiri ( yang sekarang berdiri MTs Negeri Lamongan ) dengan sarana seadanya.
Baru pada tahun 1987 atas prakarsa pengelola Madrasah dan Stakeholders, pembelajaran mulai menjadi satu, di lokasi sekarang. Sejalan dengan perkembangan pendidikan yang semakin maju serta dituntut memenuhi kebutuhan masyarakat, maka MTs Negeri Lamongan terus berbenah diri, dan berubah nama menjadi MTsN 2 Lamongan sesuai dengan
KMA No. 673 Tahun 2016 tentang Perubahan Nama MTsN.Dalam perjalanannya Madrasah Tsanawiyah Negeri 2 Lamongan sudah mengalami proses serta perkembangan yang antara lain:
1. Periode Pergantian Kepala Madrasah & Kepala Tata Usaha
A. Periode Pergantian Kepala Madrasah.
1. Bpk. H. Hudlori, BA. (Alm)(1979-1989)
2. Bpk. Drs. H. Mufid (Alm) (1989-1998)
3. Bpk. Moh. Musyafak, BcHk. (1998-2004)
4. Bpk. Drs. H. Supandi, M.Pd (2004-2005)
5. Bpk. Drs. H.M. Miskan Choiri, M.Ag (Alm)(2005-2008)
6. Bpk. Drs. H.M. Syamsuri, M.Pd (2008-2010)
7. Ibu. Dra. Hj. Nurie Fatmawatie Ch, M.Ag (Alm) (2010-2011)
8. Bpk. Drs. H. Abdul Hayat (2011-2013)
9. Bpk. Drs. Abdur Rozaq Z, M.Pd.I (2013-20118)
10. Ibu. Nur Endah Mahmudah, S.Ag. M.Pd.I (2018-2021)
11. Bpk. Asman, S.Ag. S.Pd. (2021-….)
B. Periode Pergantian Kepala Tata Usaha
1. Drs. H. F. Yahya (1984-1991)
2. Drs. H. Agus Salim (1991-1998)
3. H. Sumiran. Smhk (1998-2000)
4. Suhanto, SH. (2000-2005)
5. H. Mukhtar Badri, SH. (2005-2009)
6. H. Amin, SH. (2009-2019)
7. H. Miftakhuddin, S.Ag. MA. (2019-20…)
2. Ruang Belajar dan Sarana Prasarana yang mendukung